Au sein de l'Unité de Recherche InBioS, le laboratoire de génétique et physiologie des microalgues conserve une collection complète de microalgues regroupant notamment l’algue verte Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophytes), l’algue rouge Galdieria sulphuraria, la diatomée Thalassiosira pseudonana (Bacillariophytes), l’algue verte secondaire Euglena gracilis (Euglenophytes), ou encore la dinoflagellées Symbiodinium (Dinophytes).
Lorsque le Pr Matagne a commencé à constituer cette collection dans les année 80, elle comptait 450 souches. Actuellement, elle en compte près du double. Ce sont principalement des mutants de la microalgue verte Chlamydomonas reinhardtii, par exemple des mutants déficients pour un acide aminé, l'arginine. Les souches sont maintenues dans des tubes en verre que l'on repique tous les 6 mois. On a également une collection maintenue dans l'azote liquide, qu'on ne doit donc pas repiquer.
La collection comprend quelques espèces remarquables d'un point vue écologique par exemple certaines dinoflagellées, algues marines de couleur brun-orange, ont la capacité exceptionnelle de vivre en symbiose à l'intérieur des cellules de certains animaux comme les coraux ou les méduses.
Les mutants de la microalgue verte Chlamydomonas reinhardtii ont été cruciaux pour l'élaboration de la transformation du génome de l’algue et sa domestication. Ils sont abondamment utilisés pour les travaux pratiques des étudiants.
On trouve aussi dans cette collection des mutants qui sont déficients pour les processus de respiration et photosynthèse. Leur caractérisation a constitué et constitue toujours l’élément fédérateur et important des recherches menées dans le laboratoire. La collection comprend des souches présentant de larges variations au niveau de leur génome. Leur étude nous permet d'identifier les caractères et traits génétiques responsables de l'efficacité de la photosynthèse.
D'autres recherches ont pour but d'identifier les relations entre photosynthèse, mouvement des microalgues et protection vis-à-vis des lumières intenses, de fabriquer des pigments, lipides et enzymes à haute valeur ajoutée ou encore d'isoler des molécules antibactériennes.
Les microalgues sont une formidable source de biocarburants et de composés valorisables 100 % écologiques. Certains projets de recherche utilisent donc des microalgues pour produire du biodiesel ou du biokérosène à partir de paille et de bois ou encore de l'hydrogène par des cellules photoenzymatiques.
Au sein de l'Unité de Recherche InBioS, le laboratoire de génétique et physiologie des microalgues conserve une collection complète de microalgues regroupant notamment l’algue verte Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophytes), l’algue rouge Galdieria sulphuraria, la diatomée Thalassiosira pseudonana (Bacillariophytes), l’algue verte secondaire Euglena gracilis (Euglenophytes), ou encore la dinoflagellées Symbiodinium (Dinophytes).
